Όποιος έχει ασχοληθεί με τη μοριακή βιολογία το ξέρει Escherichia coli είναι ο οργανισμός-πρότυπο για αρκετό καιρό. Ως οργανισμός που είναι εύκολο να αναπτυχθεί και εύκολο να χειριστεί γενετικά στο εργαστήριο, μι. coli έχει γίνει ένας από τους πιο συχνά χρησιμοποιούμενους μικροοργανισμούς σε εργαστήρια που μελετούν μια ποικιλία βιολογικών συστημάτων. Έχει χρησιμοποιηθεί για να ενημερώσει τη συμπεριφορά άλλων βακτηρίων (με τα οποία μπορεί να είναι πιο δύσκολο να αναπτυχθούν ή να δουλέψουν πιο δύσκολα). Εκτός αυστηρά μικροβιολογικής έρευνας, μι. coli έχει χρησιμοποιηθεί για την παραγωγή πολλών βιομορίων με την εισαγωγή γονιδίων που απαιτούνται για την παραγωγή αυτών των μορίων στο βακτήριο.
Σε ένα έγγραφο που δημοσιεύτηκε στο Nature στις 29 Αυγούστου 2016, Weinstock et al. από την Synthetic Genomics, Inc. περιέγραψε την ανάπτυξη γενετικών εργαλείων για Vibrio natriegensένα μικρόβιο που αναπτύσσεται ακόμη πιο γρήγορα από μι. coli και μπορεί σύντομα να ανταγωνιστεί μι. coli ως το εργαστηριακό άλογο.
Παρουσιάζοντας Vibrio natriegens
V. natriegens ήταν απομονώθηκε για πρώτη φορά από εμπλουτισμένη λάσπη ελών το 1958 από το νησί Sapelo, Georgia από τον William J. Payne του Πανεπιστημίου της Γεωργίας. Διαφορετικός Vibrio cholerae (ο αιτιολογικός παράγοντας της χολέρας), V. natriegens είναι μη παθογόνος.
Σε σύγκριση με πολλά μικρόβια, μι. coliΟ χρόνος διπλασιασμού των 20 λεπτών μπορεί να φαίνεται αξιοσημείωτος. Πολλά μικρόβια χρειάζονται μέρες ή εβδομάδες για να αποκτήσουν αρκετή βιομάζα για να εργαστούν στο εργαστήριο. V. natriegens υπερβαίνει τον ρυθμό ανάπτυξης του μι. coli κατά περισσότερο από δύο φορές και έχει χρόνο διπλασιασμού λιγότερο από 10 λεπτά! Με τη χρήση V. natriegens στο εργαστήριο αντί για μι. coliτα πειράματα που διήρκεσαν μερικές ημέρες θα μπορούσαν να ολοκληρωθούν σε μία ημέρα.
Βελτιστοποίηση Vibrio natriegens για γενετική έλξη
μι. coli τα στελέχη που χρησιμοποιούνται στο εργαστήριο δεν είναι τα ίδια με τα μι. coli στελέχη που βρίσκονται στη φύση. Τα στελέχη που χρησιμοποιούνται στο εργαστήριο έχουν τροποποιηθεί για να τα καταστήσουν πιο γενετικά μεταφερόμενα. Στη φύση, μι. coli (και άλλα βακτήρια) διαθέτουν γονίδια που προστατεύονται από την εισβολή ξένου DNA. Πολλές φορές, το ξένο DNA είναι επικίνδυνο για το κύτταρο, ιδιαίτερα εάν το βακτηριακό κύτταρο καταληφθεί από ιούς. Τα εργαστηριακά στελέχη του μι. coli έχουν αφαιρέσει αυτά τα συστήματα έτσι ώστε οι ερευνητές να μπορούν να εισάγουν θραύσματα DNA στο βακτήριο. Οι Weinstock et al. αφαίρεσε αυτά τα γονίδια από V. natriegens καθιστώντας το βακτήριο πιο επιδεκτικό σε εργαστηριακά πειράματα.
Συνθετική Γονιδιωματική σχεδιάζει να συνεχίσει τη βελτιστοποίηση V. natriegenes και θα εμπορευτεί αυτό το βακτήριο με την επωνυμία Vmax για ερευνητικές και εμπορικές χρήσεις.
Σχετίζεται με
